Всяка година през пролетта и есента едно велико и тайнствено събитие настъпва в небето над езерото - голямата миграция по хилядолетния прелетен път - Via Pontica. Огромни ята от щъркели, пеликани, грабливи и пойни птици безшумно минават над езерото и ни напомнят, че природните закони са толкова велики, колкото велик може да бъде само животът. Никой не може да каже как го правят и какво ги кара всяка година да летят хиляди километри. Но едно е сигурно – Атанасовско езеро е едно от най-важните и ключови места по пътя на птиците и е с неоценимо значение за тяхното оцеляване.